Наследственная генетика: текущие исследования

Абстрактный

Эпигеномные показатели возраста у афроамериканцев

Дженнифер А. Смит, Алисия Л. Загель, Ян В. Сан, Дэна С. Долиной, Лоуренс Ф. Белак, Патрисия А. Пейсер, Стивен Т. Тернер, Томас Х. Мосли-младший и Шэрон Л. Р. Кардиа

Возраст является общепризнанным фактором риска хронических заболеваний. Однако клеточные и молекулярные изменения, связанные с процессами старения, которые связаны с возникновением и прогрессированием хронических заболеваний, изучены недостаточно. Таким образом, возрастает потребность в выявлении новых маркеров клеточных и молекулярных изменений, которые происходят в процессе старения. В этом исследовании мы используем метилирование ДНК по всему геному из 26 428 участков CpG в 13 877 генах, чтобы изучить связь между возрастом и эпигенетическими вариациями в клетках периферической крови 972 взрослых афроамериканцев из исследования Genetic Epidemiology Network of Arteriopathy (GENOA) (средний возраст = 66,3 года, диапазон = 39-95). Возраст был значимо связан с 7 601 (28,8%) участками CpG после коррекции Бонферрони для α = 0,05 (p < 1,89 × 10-6). Из-за необычайно сильных ассоциаций между возрастом и многими сайтами CpG (>7000 сайтов с p -значениями в диапазоне от 10â€'6 до 10-43) мы исследовали, насколько хорошо маркеры метилирования ДНК предсказывают возраст. Мы обнаружили, что 2095 (7,9%) сайтов CpG были значимыми предикторами возраста после коррекции Бонферрони. Пять главных компонентов 2095 сайтов CpG, связанных с возрастом, составляли 69,3% изменчивости в этих сайтах CpG, и они объясняли 26,8% изменчивости возраста. Ассоциации между маркерами метилирования и возрастом взрослого человека настолько повсеместны и сильны, что мы предполагаем, что паттерны метилирования ДНК могут быть важной мерой процессов клеточного старения. Учитывая высококоррелированную природу эпигенома, связанного с возрастом (о чем свидетельствует анализ главных компонентов), целые пути могут регулироваться в результате старения.