Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Эпигенетика Эволюция и замена гистонов: эволюционные изменения у Drosophila H2AvD

Ёсинори Мацуо

Эволюционные изменения генов Drosophila H2A и H2AvD, кодирующих гистоны, были проанализированы с использованием последовательностей 12 видов Drosophila для понимания эволюции замены гистонов и эпигенетики. Ген Ball, кодирующий гистоновую треонинкиназу, был расположен голова к голове с геном H2AvD у семи видов Drosophila. Сильно консервативная последовательность ДНК также была обнаружена в области выше гена H2AvD; эта последовательность, скорее всего, является транскрипционным сигналом, поскольку последовательность также была сохранена у четырех других видов Drosophila, у которых не было гена Ball выше по течению. Ген SPARC, кодирующий домен связывания кальция, был расположен хвост к хвосту в области ниже гена H2AvD у 11 изученных видов Drosophila. Умеренно консервативная последовательность ДНК была обнаружена в области гена H2AvD в месте сплайсинга в первом интроне. Различное использование кодонов для генов H2A и H2AvD было обнаружено для 11 из 17 аминокислот, а использование кодонов, характерное для замещающих гистонов (H2AvD, H4r, H3.3A и H3.3B), было обнаружено для аминокислот. Использование кодонов значительно отличалось в нескольких сайтах модификации гистонов в гене H2A. Эти результаты предполагают, что в отличие от генов H3.3 и H4r, в гене H2AvD играл роль не только посттранскрипционный контроль, но и транскрипционный контроль. В дополнение к посттранскрипционному контролю, такому как сплайсинг и трансляция, развитие системы контроля транскрипции должно было произойти в ходе эволюции систем замещения гистонов и эпигенетических систем.