Журнал болезней крови и переливания крови

Абстрактный

Молекулярный анализ потенциального препарата Паритапревир против микобактерий туберкулеза (МТБ)

Иван Вито Феррари*, Паоло Патрицио

Mycobacterium tuberculosis (Mtb) является возбудителем туберкулеза, который ежегодно убивает 1,8 миллиона человек. Это инфекционное заболевание, которое обычно поражает легкие, но может также поражать другие части тела. РНК-полимераза Mtb (РНКП) является мишенью противотуберкулезного препарата первой линии Рифампицин (Rif). Мы впервые сообщаем о потенциальном препарате Паритапревир против тяжелого инфекционного заболевания с помощью подхода in silico , используя Auto dock Vina и Auto dock 4 (или MGL Tool), оцененного с помощью программного обеспечения Pyrx и AM Dock, вычисляя три различных важных параметра: сродство связывания (ккал/моль), оцененный Ki (в нМ единицах) и эффективность лиганда (LE в ккал/моль). После выборочного анализа более 1000 препаратов, обработанных с помощью Pyrx (программное обеспечение виртуального скрининга для вычислительного обнаружения лекарств) в кармане сайта связывания лиганда белка (ID PDB 5UHB цепь C, ДНК-направленная РНК-полимераза субъединица бета), мы заметили высокие значения этих 3 параметров, упомянутых выше, для паритапревира, заключив, что он может быть отличным кандидатом на лекарство от этого типа инфекции. Действительно, из результатов Auto dock Vina и Auto dock 4 (или Auto dock 4.2), реализованных с помощью генетических алгоритмов Ламарка, LGA, через программное обеспечение AM Dock, этот пероральный препарат, одобренный FDA в 2014 году как Auto dock Vina, так и Auto dock Vina 4, имеет превосходное значение сродства связывания, около -10,00 ккал/моль, значение Ki 40 нМ и эффективность лиганда около -0,15 ккал/моль. Эти результаты сопоставимы с препаратом, кристаллизованным в вышеупомянутом белке, который в настоящее время используется против туберкулеза.