Леандро Коста Лима Верде, Тьяго Родригес и Силва, Бруна Мартинс Делланьеззе, Эужениу Вас душ Сантос Нето и Валерия Майя де Оливейра
Биодеградация может привести к физико-химическим изменениям свойств сырой нефти и природного газа, что приводит к снижению содержания насыщенных углеводородов и получению тяжелой нефти с низкой экономической ценностью. Исследования разнообразия микробных катаболических генов в нефтяных пластах немногочисленны и могут помочь предсказать потенциал образца нефти для биодеградации. Целью данного исследования была оценка разнообразия генов, участвующих в деградации углеводородов в бразильских образцах нефти (биодеградированных и небиодеградированных) посредством построения и анализа библиотек генов (алканмонооксигеназа – alk, диоксигеназа – ARHDs и 6-оксоциклогекс-1-ен-1-карбонил-КоА-гидролаза – bamA). Результаты показали дифференциальное распределение катаболических генов между участками, причем биодеградированная нефть более разнообразна для генов alk и bamA. Последовательности были похожи на гены alkB из Geobacillus thermoleovorans и нескольких видов Acinetobacter, на гены ARHD из Pseudomonas spp. и двух видов Burkholderia, а также на гены bamA из deltaproteobacteria. Интересно, что большинство катаболических последовательностей, извлеченных из обоих нефтяных резервуаров, сгруппировались вместе, образуя отдельные кластеры в реконструкции филогенетического дерева, и могут соответствовать потенциально новым генам, возможно, содержащимся в еще не культивируемых микроорганизмах. Это первый отчет об обнаружении генов alk, ARHD и bamA в средах нефтяных резервуаров, демонстрирующий генетический потенциал таких микробных сообществ для биодеградации нефти.