Ён Чонг и Хидеюки Икемацу
Влияние вакцинации на динамику вируса гриппа остается в значительной степени неизвестным. Различные штаммы вакцины A/H3N2 использовались в Японии и Соединенных Штатах (США) в сезоне 2014-2015 гг. Чтобы изучить, как различные штаммы вакцины влияют на выбор выживающих вариантов, мы сравнили последовательности гемагглютинина (ГА) в Японии с таковыми в США. Всего было выделено 85 образцов A/H3N2 от 38 вакцинированных и 47 невакцинированных японских пациентов (33 из сезона 2013-2014 и 52 из сезона 2014-2015 в Японии) и подвергнуто генетическому анализу с использованием секвенатора следующего поколения для сравнения со 113 изолятами из США (30 из сезона 2013-2014 и 83 из сезона 2014-2015), на которые ссылаются в базе данных GenBank. Различия в аминокислотах HA1 (AA) между Японией и США для штаммов вакцины 2014-2015 гг. были обнаружены на участках 128 (эпитоп B), 142 (A), 145 (A) и 198 (B). 145S и 198S в японских изолятах, которые совпадали с таковыми в штамме вакцины 2014-2015 гг., значительно снизились между двумя сезонами, в отличие от полного сохранения изолятов США (57,6% против 5,8% для 145S, P < 0,0001; 100,0% против 75,0% для 198S, P = 0,0012). Преобладание 128A и 142G также было утрачено в японских изолятах, как это наблюдалось при сопоставлении этих АА с таковыми из вакцинного штамма 2014-2015 годов (72,7% против 19,2% для 128A, P < 0,0001; 75,8% против 15,4% для 142G, P < 0,0001). Наши данные свидетельствуют о том, что выбор вакцины может быть связан с появлением вариантов гриппа, генетически далеких от вакцинных штаммов.