Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Разработка простого и быстрого метода диагностики вируса латентной кольцевой пятнистости клубники в растениях с использованием метода петлевой изотермической амплификации

Джин-Хо Ким, Шивон Ли, Джи-Ён Чой, Сью Кён Ким и Вон-Чоль Чан

Вирус латентной кольцевой пятнистости клубники (SLRSV) — это вирус, передающийся через семена или нематоды, который вызывает количественные и качественные потери различных культур. SLRSV — это не зарегистрированный, потенциально контролируемый вирус, который контролируется на национальном уровне. В настоящее время ОТ-ПЦР и система гнездовой ПЦР являются стандартными методами обнаружения SLRSV, но требуются более эффективные методы. В этом исследовании для обнаружения SLRSV использовался анализ петлевой изотермической амплификации (LAMP). В результате анализ LAMP показал чувствительность, аналогичную чувствительности используемого в настоящее время метода, но он более быстрый (примерно 8 часов), простой и специфичный. Кроме того, результаты можно проверить с помощью полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (RFLP) с использованием BfaI или секвенирования после реакции LAMP. Таким образом, мы показали, что анализ LAMP, разработанный в данном исследовании, является потенциальным маркером для облегчения быстрого и простого скрининга SLRSV в растениях, что в конечном итоге будет полезно для диагностики растений , инфицированных SLRSV, и карантина.