Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Разработка мультиплексной ПЦР для специфического обнаружения Xanthomonas campestris pv. campestris в капусте и корреляция с заболеваемостью

РК Рухи и С. Умеша

Черная гниль, наиболее серьезное заболевание крестоцветных, особенно Brassica oleracea var. capitata (капуста), вызывает огромные потери урожая. Черная гниль — это заболевание, передающееся через семена, и оценка семян на наличие патогена очень важна. Семена капусты были проверены на наличие инфекции X. campestris pv. campestris с помощью биохимического и ПЦР-анализа. Образцы семян были подвергнуты ПЦР-анализу с тремя праймерами, из которых одна из пар праймеров, специфичных для гена hrpF, могла обнаружить патоген черной гнили. Текущее исследование является первым в своем роде, в котором местные сорта капусты были оценены с помощью молекулярных анализов, а широко выращиваемые сорта в исследуемой области были проверены на корреляцию между лабораторными и полевыми показателями. Целью исследования было использование доступных специфических и чувствительных процедур на основе ПЦР для рутинного обнаружения X. campestris pv. campestris в семенах капусты. Мультиплексная ПЦР была стандартизирована для одновременного обнаружения патогена и видов Brassica, внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) в инфицированном материале семян и листьев. Были получены мультиплексные ПЦР-отпечатки, которые амплифицировали фрагмент гена hrpF длиной 619 пар оснований из X. campestris pv. campestris и участок области внутреннего транскрибируемого спейсера длиной 360 пар оснований из Brassica sp. Анализ также легко обнаруживал инфекции X. campestris pv. campestris в больных растениях и из бактериальных колоний, изолированных на селективных средах, и был более чувствительным и специфичным, чем традиционные методы посева. Таким образом, с помощью мультиплексной ПЦР стало возможным определение порогового уровня для обнаружения бактерий в семенах капусты.