Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Разработка колориметрического петлевого изотермического амплификатора для быстрого обнаружения вируса желтой курчавости листьев томата

Мохаммад Амин Алмаси, Мехди Агапур Оджагканди, Ахмад Хемматабади, Фатх Хамиди и Саид Агаи

Анализ изотермической амплификации с петлевой опосредованностью (LAMP) — это новый метод амплификации ДНК при постоянной температуре с высокой специфичностью, чувствительностью, скоростью и эффективностью. Мы впервые применили протокол быстрого обнаружения, который использует колориметрическую изотермическую амплификацию с петлевой опосредованностью для обнаружения вируса желтой курчавости листьев томата. В этой связи все четыре праймера LAMP (то есть F3, B3, FIP и BIP) вместе с праймерами ПЦР (F и R) были разработаны на основе гена SF последовательностей ДНК TYLCV. Несмотря на то, что анализы DAS-ELISA, ПЦР и LAMP могли успешно обнаруживать положительные инфицированные образцы, учитывая время, безопасность, чувствительность, стоимость и простоту, последний был в целом лучше. Между тем, среди пяти различных визуальных красителей для точного обнаружения продуктов LAMP как гидроксинафтоловый синий, так и GeneFinderTM могли производить длительное стабильное изменение цвета и яркости в закрытом пробирочном подходе для предотвращения риска перекрестного заражения, в конечном итоге были признаны лучшими. В целом все результаты свидетельствуют о том, что LAMP предлагает интересный новый и удобный формат анализа для быстрого,
чувствительного, экономически эффективного и достаточно простого в использовании диагностического инструмента распознавания вируса желтой курчавости листьев томата и, следовательно, представляет собой альтернативу анализам на основе ПЦР.