Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Разработка метода ОТ-ПЦР в реальном времени для быстрого обнаружения и количественной оценки вируса южной черной полосатой карликовости риса

Сунбай Чжан, Дэйонг Чжан, Юн Лю, Сянвэнь Ло, Цзюэ Чэн и Цзин Пэн

Southern Rice Black-Streaked Dwarf Virus (SRBSDV) — новый вид патогена в группе 2 рода Fijivirus , который за последние четыре года (2008-2011) вызвал серьезную потерю урожая многих важных зерновых культур, таких как рис и кукуруза, которые импортируются в Китай и Юго-Восточную Азию. Примечательно, что у раннего инфицированного риса нет типичных симптомов, которые могут предотвратить серьезную потерю урожая. Поэтому очень важно обнаружить раннюю стадию заражения SRBSDV в рисе. С этой целью был разработан и использован метод ОТ-ПЦР в реальном времени для обнаружения этого вируса в образцах риса, а также его сравнили с обычной ОТ-ПЦР. Результат показал, что ОТ-ПЦР в реальном времени обладает высокой специфичностью и чувствительностью для обнаружения SRBSDV, а связь между значениями Ct и числом копий SRBSDV была линейной с диапазоном 4,04×10 ² -4,04×10 ⁷ копий/реакцию, а чувствительность достигала 150 копий/реакцию. Внутри- и межанализная изменчивость была низкой. ОТ-ПЦР в реальном времени обнаружила SRBSDV в 87,5% - 100% образцов полевого риса по сравнению с 63,6% - 100% при обычной ОТ-ПЦР. В целом ОТ-ПЦР в реальном времени является ценным альтернативным методом для обнаружения SRBSDV в рисе.