Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Выявление возбудителей пектобактерий мягкой гнили картофеля в северо-западных провинциях Ирана

Сима Азадманеш, Алиреза Марефат и Кайхан Азадманеш

Известно, что различные бактерии, принадлежащие к Enterobacteriaceae, являются возбудителями черной ножки и мягкой гнили картофеля. В этом исследовании быстрый и специфический метод обнаружения использовался для изучения бактерий в некоторых северо-западных провинциях Ирана (Зенджан, Курдистан и восточный Азербайджан). Для исследования были отобраны 26 штаммов, которые были идентифицированы в предыдущих исследованиях как репрезентативные патогены, они были следующими: 14 Pectobactrium carotovorum subsp carotovorum, 7 Dickeya chrysanthemi и 5 Pectobactrium atrosepticum. Праймеры Y1/Y2, Expccf/r, ADE1/2 и Eca1f/r, опубликованные как специфические праймеры для патогенов. Они были протестированы, чтобы определить, можно ли их использовать для специфической амплификации ДНК в штаммах. Ожидаемый специфический фрагмент не был амплифицирован во многих штаммах или были амплифицированы несколько неспецифических полос, некоторые близкие к этим ожидаемым фрагментам. Специфические праймеры для амплификации ДНК патогенов были разработаны путем секвенирования области ITS из репрезентативных штаммов, и
был разработан ПЦР-тест. В ПЦР-тесте фрагмент размером 300 п.н. был амплифицирован из всех штаммов, собранных в провинциях. В тестах на специфичность не было получено никаких продуктов ПЦР от других бактерий, принадлежащих к другим родам.