Генная технология

Абстрактный

Обнаружение 5-карбоксилцитозина в ДНК клеток млекопитающих

Ихуа Гао, Цзянь Ли, Бинь Чен, Цинцзинь Ян, Цзюньцзе Чжан, Лицзянь Чжан, Цюнлинь Хуан, Сяося Е и Чун Цай

5-карбоксилцитозин (5caC) является важным производным модификации цитозина в пути деметилирования ДНК. Однако точная количественная оценка 5caC является сложной задачей, особенно в тканях млекопитающих. Такое положение, вероятно, является результатом следового количества 5caC в клетках млекопитающих и недостаточной чувствительности существующих технологий. В настоящей работе мы сообщаем о новом методе ЖХ-МС/МС для точной количественной оценки 5caC в клетках млекопитающих. Был синтезирован стандартный реагент 5caC, геномная ДНК была гидролизована муравьиной кислотой, а целевое соединение 5caC было обнаружено с помощью HILIC ЖХ-МС/МС. Результаты показали, что 5caC обычно присутствует в органах и раковых тканях мышей. Содержание 5caC в мозге мышей было выше, чем в легких и печени, и было явно снижено в тканях колоректального рака по сравнению с соседней тканью. Этот результат предполагает, что 5caC, вероятно, связан с онкогенезом и играет доминирующую роль в эпигенетическом контроле нейронной функции.