Журнал передовой химической инженерии

Абстрактный

Кристаллографические данные и качество модели – за пределами 0,8 Å и независимая модель атома

Маура Малинска

Обычно в случае рутинного анализа рентгеновских данных используется модель независимого атома (IAM) электронной плотности. Однако эта модель не дает количественного описания распределения электронной плотности, поскольку предполагается, что атомы нейтральны и сферичны. Целью проекта является использование новых методов, которые были разработаны для реконструкции электронной плотности по данным рентгеновской дифракции CuKα. Эти методы - модель плотности с ориентированной деформацией связей (BODD). Наше исследование показало соответствие результатов после уточнений по данным MoKα и CuKα. Наблюдаемые систематические ошибки для данных CuKα: систематически более высокие ADP тяжелых атомов и меньшая информация о плотности в картах остаточной плотности и графиках фрактальной размерности. Это связано с объемом информации, доступной в данных CuKα. Несомненно, использование описанных методов приводит к более точным и аккуратным конечным структурам по сравнению со структурой IAM. Как и ожидалось, методы HAR и TAAM точнее и аккуратнее, чем BODD, в то время как BODD быстрее и удобнее для пользователя. Результаты HAR и TAAM схожи, однако для уточнения HAR мы рекомендуем оценивать ADP атомов водорода с помощью сервера SHADE.