Фармацевтика Аналитика Акта

Абстрактный

Конформация антигенного пептида тирозиназы (192-200) в воде и ДМСО-d6 с помощью ЯМР-спектроскопии и моделирования МД

Эванс С. Коутиньо, Мишра Н.Б., Дип Бхаттачарья, Судха Шривастава, Мамата Джоши и Муштаке Шейх

Меланомы представляют собой наиболее устойчивую форму рака. При раннем обнаружении излечение возможно с помощью обычных методов лечения, в то время как метастатические формы практически устойчивы к обычным методам лечения. Новая область, а именно иммунная терапия, обещает цитолитическую активность против опухолевых клеток. Производство антител против антигенных эпитопов, присутствующих в меланоме, является основной основой этой иммунной терапии. Производство ответа Т-клеток против опухолевых клеток было замечено с помощью синтетических антигенных эпитопов. Антигенный нонамерный пептидный эпитоп тирозиназы (192-200) с последовательностью S1EIWR5DIDF9 вызывает значительную индукцию ответа Т-клеток у пациентов с меланомой. В области значимости этого пептида была исследована структура ЯМР в растворенном состоянии аминокислотного участка тирозиназы 192-200, чтобы усвоить связь между антигенностью и конформацией пептида. Исследования ЯМР проводились в растворителях H2O:D2O (95:5) и DMSO-d6. Молекулярно-динамическое моделирование с ограничениями ЯМР проводилось с использованием пакета GROMACS v .4.6.5. Результаты показывают преобладание структуры β-слоя как в H2O, так и в DMSO-d6.