Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Согласованная эволюция семейства генов гистонов, зависимых от репликации, у иммигрантов Drosophila

Какубаяши Н., Фудзита Э., Морикава М., Охаси С. и Мацуо Ю.

Репликация-зависимые гены гистонов в Drosophila immigrans были проанализированы для выяснения эволюционного механизма семейства мультигенов гистонов. Был клонирован регион размером приблизительно 3,9 кб, содержащий гены H2A-H2B-H1. Шесть независимых клонов были секвенированы и проанализированы на предмет изменчивости нуклеотидов. Средняя идентичность нуклеотидной последовательности в регионе среди повторяющихся копий составила более 99%, что указывает на то, что семейство мультигенов гистонов в D. immigrans развивалось согласованным образом и на том же уровне, что и в D. melanogaster. Аминокислотные варианты были обнаружены с низкой частотой. Анализ содержания GC в 3-й позиции кодона генов гистонов показал, что изменение содержания GC, т. е. уменьшение, наблюдаемое у D. hydei и D. americana, произошло после расхождения предка этих двух видов от D. immigrans.