Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Анализ сложности и энтропии ДНК-метилтрансферазы

Сяоли Се, Ин Ю, Джордж Лю, Чжифа Юань и Цзючжоу Сун

Предыстория: Применение информации о сложности последовательности ДНК и белка в биологических процессах хорошо изучено в этом исследовании. Доступные последовательности для гена DNMT1 были тщательно изучены в информационных сложностях. Ген DNMT1 является поддерживающей метилтрансферазой, отвечающей за копирование паттернов метилирования ДНК в дочерние цепи во время репликации ДНК у разных видов. Результаты: Мы обнаружили, что энтропия гена DNMT1 у разных видов зависит от состава оснований ДНК, и его сложность у млекопитающих ниже в интронах, чем в кодирующих областях. Мы также продемонстрировали влияние энтропии на домены и не-домены гена DNMT1. Результаты по последовательностям ДНК и белка показали, что эволюция ДНК имеет тенденцию к сложности. Наибольший интерес представляет то, что изменения метилирования гена с возрастом в уникальной модели цыпленка показали характеристики энтропии, обусловленные старением, которые могут дать объяснение процессам старения. Заключение: Подводя итог, можно сказать, что информационная сложность гена DNMT1 связана с его геномным составом, который, таким образом, ассоциируется с эволюционными и старческими процессами, хотя внутренний механизм еще не изучен.