Триш Р. Кахамба*, Лара Нобл, Венди Стивенс, Лесли Скотт
Адекватный сбор образцов мазков, высвобождение и обнаружение нуклеиновых кислот с помощью молекулярных диагностических анализов во многом объясняется физическими и химическими характеристиками различных типов мазков. Мы исследовали свойства трех типов коммерческих носоглоточных мазков (нейлоновые флокированные: Type-1 Media Merge; Type-2 Kang Jian Medical Apparatus, Китай и Type-3 Wuxi NEST Biotechnology Co. Ltd, Китай), используемых в клинической диагностике, с целью установить, оказывают ли различные конструкции и конфигурации мазков какое-либо влияние на эффективность мазков. Исследуемые свойства включали вирусную абсорбцию, высвобождение, захват, извлечение и эффективность восстановления из каждого мазка для обнаружения тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса-2 (SARS-CoV-2). Все типы мазков (n=18) были инокулированы различными количествами живых вирусных культур SARS-CoV-2 (разведение 1:10, 1:100 и 1:1000) и элюированы в стерильном фосфатном буферном физиологическом растворе. РНК была извлечена из всех элюатов мазков с использованием полностью автоматизированной системы (система BD MAX™), и значения порога цикла (Ct) были сравнены. Стабильность РНК также была исследована после сухого хранения мазков при комнатной температуре в течение 72 часов. Статистически значимые различия (p<0,05) наблюдались в возможностях абсорбции и высвобождения между мазками типа 1 и 3, а также между мазками типа 2 и 3, однако существенных различий между мазками типа 1 и 2 не наблюдалось. Значения Ct и количество эффективности экстракции SARS-CoV-2 различались среди типов мазков. Мы пришли к выводу, что для обеспечения точной диагностики SARS-CoV-2 важна оценка характеристик мазков из носоглотки перед их сбором в клинических условиях.