Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Сравнительные исследования генов и белков митохондриальной карбоангидразы (CA5) позвоночных: доказательства дупликации генов у млекопитающих, при этом ген CA5A специфичен для печени, а ген CA5B широко экспрессируется и локализуется на X-хромосоме

Роджер С. Холмс

По крайней мере пятнадцать семейств карбоангидраз млекопитающих (CA) (EC 4.2.1.2) катализируют гидратацию углекислого газа и связанные с этим функции. Гены CA5A и CA5B кодируют различные митохондриальные ферменты и выполняют важные биохимические функции, включая детоксикацию аммиака и метаболизм глюкозы. Биоинформационные методы использовались для прогнозирования аминокислотных последовательностей, вторичных структур и местоположений генов и белков CA5A и CA5B с использованием данных из проектов по геному позвоночных. Гены CA5A и CA5B обычно содержали 7 кодирующих экзонов для каждого из исследованных геномов позвоночных. Субъединицы человека CA5A и CA5B содержали 305 и 317 аминокислот соответственно, причем ключевые аминокислотные остатки включали митохондриальные транзитные пептиды; три сайта связывания цинка (His130, His132, His155); и активный сайт Tyr164. Филогенетический анализ семейств генов CA5 позвоночных показал, что это древний ген в эволюции позвоночных, который претерпел событие дупликации гена в предковом геноме млекопитающих, образовав семейства генов CA5A и CA5B у однопроходных, сумчатых и плацентарных млекопитающих. CA5A преимущественно экспрессировался в печени, тогда как CA5B имел широкий профиль распределения в тканях, был локализован на X-хромосоме и был более консервативен в ходе эволюции млекопитающих.