Мухаммад Сибте Хасан Махмуд
Использование пестицидов и инсектицидов возросло в сельскохозяйственных и домашних хозяйствах и т. д. для борьбы с вредителями, борьбы с вредителями и предотвращения заболеваний, вызываемых насекомыми, соответственно, за определенный период. Инсектициды также являются категорией пестицидов. Некоторые из наиболее широко используемых пестицидов содержат органофосфатные соединения в качестве основного ингредиента. Органофосфатные соединения представляют собой эфирные, амидные и тиоловые производные фосфорной кислоты. Такие соединения являются высокотоксичными, и их накопление в организме человека может вызвать нейроотравление. Они дезактивируют ацетилхолинэстеразу человека (АХЭ) и, таким образом, останавливают нейротрансмиссию ацетилхолина. Хотя этот процесс не является постоянным, он зависит от того, сколько времени заняло взаимодействие между органофосфатным соединением и АХЭ до начала старения и денатурации фермента. До старения фермента группа соединений, известных как оксимы, принадлежащих к семейству аминов, может быть использована для реактивации ацетилхолинэстеразы человека.
Оксимы делятся на четыре подкатегории, а именно: альдоксимы, кетоксимы, эфиры оксимов и стероидные оксимы в зависимости от их химической ориентации. Первый оксим был разработан Чешской Республикой в 1956 году. Среди них обидоксим и пралидоксим используются в клинической практике в течение многих лет и синтезируются в коммерческих целях. Оксимы могут реактивировать человеческую АХЭ, удаляя фосфат, присоединенный к ее остаткам в каталитически активных сторонах, фосфорилированных органофосфатными соединениями. В этом исследовании структуры оксимов были получены из ранее проведенных экспериментов. Затем структуры были преобразованы в 2D-структуры (SDF) с помощью PubChem. Затем файлы SDF были преобразованы в формат PDB (3D) с помощью инструмента PyRx, который создал третичную структуру оксимов, которая была необходима для выполнения стыковки. Что касается человеческой AChE, структуры ингибированной AChE были загружены из Protein Data Bank в формате PDB и очищены с помощью инструмента Chimera. После подготовки 3D-структур были отобраны оксимы с наивысшими шансами реактивации ингибированной AChE путем наблюдения за взаимодействиями AChE и оксимов. Всего было отобрано 67 оксимов из разных категорий, образующих более 600 конформаций комплексов фермент-лиганд. Для дальнейшего улучшения свойств характеристики токсичности и метаболизма этих оксимов также были проверены с помощью ligplot+ и Vega ZZ.