Журнал исследований и разработок в области аквакультуры

Абстрактный

Сравнительный анализ генетического разнообразия в природных популяциях Labeo rohita и Cirrhinus marigala с использованием видоспецифичных молекулярных маркеров

Фейсал Таслим*, Шахид М, Хина Фатима, Нуман Гульзар М

Labeo rohita , широко известный как rohu, и Cirrhinus marigala , широко известный как morakkha, являются экономически наиболее важными и широко культивируемыми видами рыб на всем индийском субконтиненте. Генетическая оценка этих видов необходима для их надлежащего надзора, сохранения и прибыльного производства. Доступны различные типы молекулярных маркеров, но наиболее важными являются SSR из-за их равномерного распределения, распространенности в геноме, кодоминирования, полиморфизма, низкой стоимости обнаружения и многоаллельной природы. В этом исследовании было собрано по десять образцов каждого вида из регионов Head Punjnad, Head Muhammad Wala и Head Trimmu реки Ченаб, Пакистан. После выделения ДНК, амплификации пяти простых маркеров повторов последовательностей, их разрешения в ПААГ и аллельной оценки генотипических данных был проведен анализ различных индексов генетического разнообразия с помощью POPGENE версии 1.32, FSTAT версии 2.9.3.2, коэффициента сходства Жаккара и Дайса, простого анализа соответствий и программы SIMQUAL пакета NTSYS-PC.

В случае Labeo rohita было обнаружено всего 26 аллелей с 260 локусами, из которых 189 были полиморфными. Полиморфизм для пяти маркеров варьируется от 43,33% до 96% со средним значением 72,69%. Аллельная частота варьируется от 0,2000 до 0,9000 со средним значением 0,4600, число аллелей варьируется от 4,000 до 9,000 со средним значением 5,2000, генное разнообразие варьируется от 0,1800 до 8800 со средним значением 0,6360, а значение PIC варьируется от 0,1638 до 0,8680 со средним значением 0,6012. Попарное генетическое различие среди десяти собранных образцов варьируется от 0,400 до 0,900, в то время как попарное генетическое сходство варьируется от 0,100 до 1,000. Кластерный анализ на основе UPGMA разделил десять образцов Labeo rohita на три кластера и три подкластера. Аналогично, пять маркеров SSR Cirrhinus marigala показывают 30 аллелей с 300 локусами в десяти образцах с 240 полиморфными локусами. Полиморфизм варьируется от 70% до 96% со средним значением 80%. Частота аллелей варьируется от 0,4000 до 0,9000 со средним значением 0,6600. Число аллелей варьируется от 4,000 до 9,000 со средним значением 6,000. Разнообразие генов варьируется от 0,1800 до 0,7800 со средним значением 0,4680. Значение PIC варьируется от 0,1638 до 0,7578 со средним значением 0,4422. Попарное генетическое различие среди десяти образцов Cirrhinus marigala варьируется от 0,2000 до 0,800, а попарное сходство варьируется от 0,200 до 1,000. Кластерный анализ на основе UPGMA разделил все образцы Cirrhinus marigala на три кластера и три подкластера. Это исследование показывает, что правительство Пакистана и заинтересованные агентства должны предпринять серьезные шаги для улучшения генетической структуры этих видов, особенно Cirrhinus marigala .