Кэцзюэ Цзя и Роберт Л. Джерниган
С развитием высокопроизводительного секвенирования следующего поколения и других передовых технологий было создано большое количество профилей экспрессии генов. Многие из этих профилей доступны в общедоступных базах данных [1-3]. Сложной исследовательской проблемой, которая привлекала много внимания в прошлом, является выведение сетей регуляции генов из данных об экспрессии. Сеть регуляции генов представлена направленным графом, в котором узлы представляют факторы транскрипции или мРНК, а ребра показывают транскрипционные регуляторные отношения между двумя узлами.