Журнал исследований и разработок в области аквакультуры

Абстрактный

Характеристика прокариотического и эукариотического микробного сообщества в тихоокеанских прудах с белыми креветками

Дунвэй Хоу, Шэньчжэн Цзэн, Цзянь Лю, Мутинг Янь, Шаопин Вэн, Цзяньго Хэ Цзяньго Хэ и Чжицзянь Хуан

В этом исследовании описываются составы сообществ и доминирующие таксономии прокариотических и эукариотических микробов в 30 образцах воды из 5 различных тихоокеанских прудов с белыми креветками. Регион V4 гена 16S рРНК и гена 18S рРНК были секвенированы с помощью высокопроизводительной технологии секвенирования. Всего для классификации было отобрано 1 387 317 фрагментов гена 16S рРНК и 1 612 056 фрагментов гена 18S рРНК, включая 3 841 прокариотические операционные таксономические единицы (OTU) и 990 эукариотических OTU. Отмечено, что все последовательности 16S рРНК были связаны по меньшей мере с 47 бактериальными подразделениями, а последовательности 18S рРНК были связаны с 50 эукариотическими подразделениями соответственно. Среди всех 30 образцов доминирующее прокариотическое и эукариотическое сообщество на уровне типа имело значительное сходство по составу, но не по численности. Доминирующее прокариотическое сообщество включало Actinobacteria, Proteobacteria, Cyanobacteria, Planctomycetes, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, Chlorobi, Chloroflexi, Firmicutes и Spirochaetes. Cercozoa, Chlororhyta, Arthropoda, Stramenopiles-unidentified, Fungi-unidentified, Prymnesiophyceae, Ciliophora, Mollusca, Choanomonada и Jakobida были доминирующими составами эукариот. Аналогично, существенные различия существовали на уровне рода среди 30 образцов. Результаты по богатству и разнообразию показали, что прокариотические и эукариотические микробы обладали сложным составом сообщества в 5 прудах. При этом в разные периоды и в разных прудах значения индексов Чао, Эйса, Шеннона и Симпсона достоверно не различались (P > 0,05).