Журнал исследований и разработок в области аквакультуры

Абстрактный

кДНК, кодирующие хитинсинтазу креветки (Pandalopsis Japonica): молекулярная характеристика и анализ экспрессии

Мд. Хасан Уддовла, А Ран Ким, Вон-Гю Пак, Хён-Ву Ким*

Рост ракообразных происходит посредством линьки, периодического сбрасывания экзоскелета. Понимание генов, участвующих в метаболизме хитина, связанном с периодическим циклом линьки, важно для различных применений в аквакультуре десятиногих ракообразных. Хитинсинтаза является важным ферментом в пути биосинтеза хитина, который играет важную роль в синтезе новой кутикулы после линьки. В этом исследовании мы выделили полноразмерную кДНК, кодирующую хитинсинтазу (PajCHS), из Pandalopsis japonica с помощью комбинации клонирования на основе ПЦР (полимеразной цепной реакции) и биоинформатического анализа. Идентифицированный PajCHS кодирует трансмембранный белок с 1525 аминокислотными остатками (175 кДа). Сравнение с другими CHS насекомых показало, что PajCHS содержит три домена: N-концевой домен A, каталитический домен B и C-концевой домен C. Три консервативных мотива (EDR, QRRRW и SWGTR) также хорошо сохранились внутри и около каталитического домена B, что позволяет предположить, что Paj-CHS функционально активен. Изменение трансмембранной спирали в N-концевом и C-концевом доменах предполагает, что ориентация каждого CHS может быть разной. Филогенетический анализ показал, что PajCHS является ортологом членов группы CHS1 от видов насекомых. Однако профили экспрессии тканей показали, что эпидермис, гепатопанкреас, кишечник и жабры были основными местами производства транскрипта PajCHS, который значительно отличается от CHS1 насекомых. Результаты ПЦР в реальном времени показали, что абляция глазного стебля и инъекция 20-гидроксиэкдизона (20E) повышают уровень экспрессии мРНК PajCHS, что позволяет предположить, что экспрессия PajCHS1 может контролироваться эндогенным 20E.