Наследственная генетика: текущие исследования

Абстрактный

Краткий обмен мнениями по выбору геномных регионов и генов, связанных с адаптацией и признаками плодовитости двух колумбийских креольских пород крупного рогатого скота

К. Де Леон, Р. Мартинес

Естественный отбор и одомашнивание у видов домашнего скота являются одними из основных эволюционных изменений, приводящих к фенотипическим адаптациям; эти модели создают генетические сигнатуры в геноме. Для обнаружения сигнатур и генов, участвующих в адаптационных и фертильных признаках у двух колумбийских креольских пород крупного рогатого скота Blanco orejinegro (BON) и Sanmartinero (SM) в настоящем исследовании были обнаружены выбранные геномные регионы путем сравнения различий в региональном неравновесии сцепления (LD) с использованием 58 868 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) из BON и 57 482 SNP из SM. Также была оценена вариация LD по всему геному между популяциями с использованием программы VARLD. Верхние 0,1 и 0,01-й процентили стандартизированных оценок VarLD использовались в качестве критерия для всех сравнений. Десять регионов были обнаружены на хромосомах 3, 5, 11, 15, 18, 21, 22, 23, 25 и 29 и генах в них, таких как CTDSP2, CES1, CFAP161, CLEC14A, HIPK1, RBM4, KDMID, OLFML3, ATP23, LRRTM1, SLC6A2, DEK, SYT6, KDMID, вовлеченных в признаки адаптации и фертильности. Эти результаты открывают перспективу для разработки новых исследований на других породах крупного рогатого скота и других видах скота, которые послужат поддержкой в ​​программах генетического улучшения и сохранения.