Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Биологическая характеристика и генетическое разнообразие индийских штаммов Ralstonia solanacearum биоваров 3 и 4, вызывающих бактериальное увядание томатов

Динеш Сингх, Света Синха, Гарима Чаудхари и Ядав Д.К.

Ralstonia solanacearum биовары 3 и 4, вызывающие бактериальное увядание томатов (Solanum lycopersicum L.), являются разрушительным почвенным патогеном растений по всему миру. Восемьдесят семь изолятов R. solanacearum были выделены из увядших растений томатов из штатов Джамму и Кашмир, Химачал-Прадеш, Уттаракханд, Джаркханд, Орисса в Индии и охарактеризованы традиционными и молекулярными методами. Биовар R. solanacearum был определен с использованием набора источников углерода, и он показал, что биовар 3 R. solanacearum был обнаружен наиболее заметным (90,2 процента) во всех штатах Индии, тогда как биовар 4 был обнаружен в штатах Джаркханд и Химачал-Прадеш. Мультиплексная ПЦР филотипа отнесла все 87 изолятов R. solanacearum, инфицирующих томаты, к филотипу I. Для изучения генетического разнообразия использовались подходы BOX-PCR и мультилокусного типирования последовательностей. Продукты амплификации дали в паттерне отпечатков пальцев BOX-PCR в диапазоне от 500 п.н. до 4 к.б. и обнаружили 23 группы ДНК-типирования 87 изолятов R. solanacearum с коэффициентом сходства 50%. При мультилокусном типировании последовательностей были проведены три гена вирулентности, а именно, hrp (регуляторная регуляция транскрипции) и egl (предшественник эндоглюканазы) и гены fli C 18 штаммов R. solanacearum, принадлежащих к различным агроклиматическим зонам. На основе анализа последовательности гена egl большинство индийских штаммов R. solanacearum были очень близки друг к другу, за исключением ORT-8, UTT-23 и JHT2, и они были очень близки к штамму GMI1000. Было обнаружено много генетической изменчивости в индийских изолятах R. solanacearum независимо от места изоляции и климатических условий.