Давид Бжалава и Йоаким Диллнер
Обнаружение наличия известных и неизвестных вирусов в биологических образцах сегодня обычно выполняется с помощью вирусной метагеномики. Поскольку скорость секвенирования и стоимость за основание стремительно снижаются с появлением новых технологий секвенирования следующего поколения, таких как HiSeq (Illumina), 454 GS FLX (Roche), SOLiD (ABI) и Ion Torrent Proton (Life Technologies), биоинформатический анализ сегодня является наиболее важной и все более востребованной частью вирусного метагеномного анализа. В этом обзоре мы выделяем некоторые из основных проблем и наиболее часто применяемые биоинформатические инструменты для вирусной метагеномики.