Журнал фармакогеномики и фармакопротеомики

Абстрактный

За пределами IC 50 : на пути к надежным статистическим методам для исследований ассоциаций in vitro

Эндрю Бим и Элисон Мотсингер-Райф

Анализы цитотоксичности клеточных линий становятся все более популярными подходами для генетических и геномных исследований дифференциального цитотоксического ответа. Растет число историй успеха, но сравнительно мало оценок статистических подходов, используемых в таких исследованиях. В подавляющем большинстве этих исследований реакция концентрации суммируется с использованием подходов подгонки кривой, а затем суммарные меры используются в качестве фенотипа в последующих исследованиях генетических ассоциаций. Кривая обычно суммируется одним параметром, таким как точка перегиба кривой (например, EC/IC50). Такое моделирование делает основные предположения и имеет статистические ограничения, которые следует учитывать. В текущем обзоре мы обсуждаем ограничения EC/IC50 как фенотипа в исследованиях ассоциаций и выделяем некоторые потенциальные ограничения с помощью имитационного эксперимента. Наконец, мы обсуждаем некоторые альтернативные подходы к анализу, которые, как было показано, являются более надежными.