Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Применение и оценка метода петлевой изотермической амплификации для обнаружения афлатоксигенных грибов, загрязняющих рисовые зерна в Кении

Юмма Дуксуна*, Аллан Оле Квалла, Эндрю Ньерере, Стивен Руно

Афлатоксигенные грибы являются наиболее распространенными нитчатыми грибами, которые синтезируют афлатоксины и представляют собой основные грибковые патогены для сельскохозяйственной продукции. Афлатоксины остаются серьезной угрозой для глобальной продовольственной безопасности, эти молекулы могут быть резистентны к пище во время обработки и, кроме того, могут оставаться в пищевой цепи. Афлатоксины являются канцерогенными, гепатотоксичными, мутагенными, тератогенными, могут подавлять многочисленные метаболические системы и обладают иммунодепрессивными свойствами. Исследования афлатоксигенных штаммов могут помочь улучшить стратегии контроля и предотвратить загрязнение афлатоксигенными грибами и производство афлатоксинов в пищевых продуктах. В этом исследовании выделение видов Aspergillus основывалось на морфологических характеристиках, включая характер роста мицелия, цвет и свойства плодовых тел грибов. Инновационная методика петлевого изотермического амплифицирования была применена для амплификации гена норсолориновой кислоты. Изотермическая амплификация с петлей была оптимизирована за счет сочетания быстроты, простоты и специфичности для обнаружения целевой геномной ДНК в реакциях. Кривые амплификации, отслеживаемые турбидиметром Loopamp в реальном времени, были проанализированы с целью различения афлатоксигенных и неафлатоксигенных штаммов.

В целом, результаты показали, что метод петлевой изотермической амплификации эффективен в обнаружении афлатоксигенных штаммов с высокой специфичностью 71,5% и чувствительностью при более низких концентрациях ДНК. Кроме того, он быстрее обычной полимеразной цепной реакции. Анализ петлевой изотермической амплификации, описанный в этом исследовании, может быть перспективным инструментом для прогнозирования потенциальных угроз со стороны афлатоксигенных грибов и риска афлатоксинов в пищевых продуктах и ​​товарах.