Журнал бактериологии и паразитологии

Абстрактный

Структурное сходство антигенов как предиктор перекрестной реактивности антител

Кристофер А. Бодуан*, Том Л. Бланделл

Антитела являются важным компонентом адаптивной иммунной системы, которая функционирует для нейтрализации чужеродных захватчиков, таких как бактериальные и паразитарные патогены. Однако эпитопы В-клеток по-прежнему трудно предсказать из-за их общей неотличимости от других областей белка. Инструменты прогнозирования эпитопов в прошлом в значительной степени полагались на сходство аминокислотной последовательности; однако было показано, что внедрение трехмерного анализа структуры белка в алгоритмы прогнозирования эпитопа повышает точность обнаружения. Кроме того, структурные сравнения между антигенными белками на предмет их потенциала связывать перекрестно-реактивные антитела не были широко изучены в литературе. Недавние исследования указали на полезность изучения общих структур эпитопов при прогнозировании перекрестной реактивности антител, что может пролить свет на перекрестный иммунитет между инфекционными патогенами и аутоиммунными заболеваниями, вызванными после инфекции. Таким образом, здесь обсуждается потенциальное влияние включения сравнений структурного сходства при обнаружении общих эпитопов. Поскольку большой объем структурной информации определяется трехмерными методами вычислительного моделирования белков, возможность проведения этих анализов становится более осуществимой.