Исмаил Саадун
Микробные инфекции были признаны важной проблемой из-за появления штаммов, устойчивых к нескольким антибиотикам. Поэтому сохраняется необходимость в поиске новых антибиотиков с широким спектром действия. Одним из таких подходов является расширение скрининговой активности рода Streptomyces, поскольку он содержит большое количество производителей антибиотиков. Несколько исследований по изоляции, характеристике и генотипированию почвенных стрептомицетов Иордании и ОАЭ уже были проведены, и активность выделенных изолятов in vitro была изучена в отношении нескольких мультирезистентных патогенов. Также были исследованы оптимальные условия производства активных веществ наиболее активными штаммами Streptomyces, а также их экстракция и очистка. Было проведено секвенирование всего генома с использованием illumina для штаммов, выделенных из региона ОАЭ. Исследования показали идентификацию штаммов Streptomyces, продуцирующих антибиотики, для ингибирования всех тестируемых организмов с наблюдением различных значений Rf и спектров поглощения УФ активных веществ некоторых тестируемых препаратов. В этих штаммах не было обнаружено низкомолекулярных плазмид, что позволяет предположить, что их продукция антибиотиков, вероятно, кодируется хромосомной ДНК. ПЦР-амплификация специфической для рода последовательности в гене 16S рДНК Streptomyces позволила быстро и напрямую обнаружить виды Streptomyces, продуцирующие стрептомицин, в почве. Полное секвенирование генома показало, что штаммы разделяют различные, но родственные филетические линии с другими видами Streptomyces. Анализ AntiSMASH выявил множество кластеров биосинтетических генов (BGC) с антимикробными свойствами. Тот факт, что эти штаммы Streptomyces проявили антибиотическую активность по отношению ко всем протестированным патогенам, были извлечены из высушенных малоизученных местообитаний в Иордании и ОАЭ с суровыми условиями окружающей среды, может подтвердить идею производства новых антибиотиков в таких условиях. Все лабораторные скрининги на антибиотики, продуцирующие Streptomyces, послужат основой для биоиндустрии.