Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Анализ и мутация кодона в генах rpoB и katG и биоинформатическое исследование модели связывания RIF с помощью субъединицы РНК-полимеразы β: исследование у пациентов с туберкулезом в больнице общего профиля Мерауке, Индонезия

Кавулур ХСИ и Нгили Y

Лечение больных туберкулезом обычно осуществляется путем назначения трех типов противотуберкулезных препаратов, основными из которых являются Рифампицин (RIF) и Изониазид (INH), затем в сочетании со стрептомицином или пиразинамидом. Устойчивость к RIF обусловлена ​​мутацией гена rpoB, гена, который производит β-субъединицу РНК-полимеразы, а устойчивость к INH в значительной степени обусловлена ​​мутацией гена katG. Целью данного исследования было получение информации об ассоциации МЛУ-ТБ с родственными генами, а также информации о комбинации генотипа Mycobacterium tuberculosis у больных туберкулезом в Мерауке. Здесь мы сообщили, что большинство изолятов MDRTB устойчивы к другим противотуберкулезным препаратам, а частота мутаций rpoB526 и rpoB531 (мутации, которые встречаются с обеих сторон/в этом месте почти всегда встречаются вместе) почти одинакова, но мутация katG315 присутствует только у 16 ​​изолятов (количество мутаций, которые встречаются в katG315, меньше, чем в rpoB526 и rpoB531). Наличие изменений нуклеотида C1363A у чувствительных к шести противотуберкулезным препаратам Mycobacterium tuberculosis показало, что не все мутации rpoB вызывали устойчивость. На основании этого явления можно предположить, что механизм формирования штаммов MDR-TB начинается с мутации rpoB, за которой следует мутация katG. Это исследование демонстрирует, что механизм устойчивости к препарату, который воздействует только на один ген, например, к рифампину, который воздействует на rpoB, легче контролировать, чем к противотуберкулезным препаратам, воздействующим на несколько генов, например, к изониазиду, который воздействует и на другие гены, помимо katG.