Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

Модель туляремии на основе агентов

Оливер Этти и Саймон Дэфлер

Francisella tularensis — грозный внутриклеточный патоген. При вдыхании он приводит к системному заболеванию (туляремии) с высоким уровнем смертности. Мы стремились разработать вычислительный инструмент для инфекций, вызываемых этим классом. Биоугроза микроба, для которого отсутствуют обширные наборы данных, позволяющие вывести параметры, которые могут определить исход инфекции. Мы представляем модель на основе двухкомпонентного агента, которая имитирует ингаляционную туляремию с последующим распространением в печень и включает экспериментальные данные и подтвержденные общие параметры защитных механизмов хозяина. Этот системный подход предполагает, что начальное количество макрофагов, вероятность распространения и начальная скорость очищения от бактерий коррелируют с исходом инфекций, вызываемых Francisella. Эти результаты подчеркивают важность ранних врожденных иммунных защитных механизмов в профилактике туляремии.