Журнал патологии растений и микробиологии

Абстрактный

Дактилоскопия AFLP для идентификации внутривидовых групп Rhizoctonia solani и Waitea circinata

Бимал С. Амарадаса, Дилип Лакшман и Кинан Амундсен

Пятнистые заболевания, вызываемые сортами Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk и Waitea circinata Warcup и Talbot (анаморфы: виды Rhizoctonia), представляют серьезную угрозу для успешного содержания нескольких важных видов газонных трав. Использование полевых симптомов для идентификации возбудителей Rhizoctonia может быть сложным и вводящим в заблуждение. Различные виды Rhizoctonia и группы анастомозов (AG) различаются по чувствительности к обычно применяемым фунгицидам, а также имеют разные температурные диапазоны, благоприятствующие возникновению заболевания. Таким образом, правильная идентификация возбудителя важна для прогнозирования прогрессирования заболевания и принятия будущих решений по лечению заболевания. Группировка видов Rhizoctonia по реакциям анастомозов является сложной и требует много времени. Идентификация изолятов Rhizoctonia путем секвенирования области внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) может быть непомерно затратной. Некоторые изоляты Rhizoctonia трудно секвенировать из-за полиморфизма области ITS. Полиморфизм длин усиленных фрагментов (AFLP) — надежный и экономически эффективный метод дактилоскопии для исследования генетического разнообразия многих организмов. Детальных анализов для определения пригодности AFLP для вывода внутривидового уровня изолятов Rhizoctonia не проводилось. Целью настоящего исследования была разработка дактилоскопии AFLP для идентификации внутривидового уровня неизвестных изолятов R. solani Kühn и W. circinata. Семьдесят девять ранее охарактеризованных изолятов R. solani (n=55) и W. circinata (n=24) были проанализированы с помощью маркеров AFLP, полученных с помощью четырех пар праймеров. Метод невзвешенной парной группы со средним арифметическим (UPGMA) правильно сгруппировал изоляты R. solani и W. circinata в соответствии с их AG, подгруппой AG или разновидностью W. circinata. Анализ главных компонентов (PCA) подтвердил кластеры UPGMA. Насколько нам известно, это первый случай, когда анализ AFLP был протестирован в качестве метода расшифровки AG, подгруппы AG или разновидности W.circinata среди широкого спектра изолятов Rhizoctonia.