Одноклеточная биология

Абстрактный

Усиленная технология молекулярного обнаружения для разделения и идентификации гельминтов рыб с помощью анализа плавления высокого разрешения (HRM)

Нишма Джайсвал, Рашми Трипати и Сандип К. Малхотра

ПЦР в реальном времени в сочетании с молекулярным анализом высокого разрешения (HRM) была проведена для определения второго внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS-2) ядерной рибосомальной ДНК. Последний действовал как генетический маркер для идентификации и различения двух видов анизакид и одного вида кукулланид, паразитирующих в морских и пресноводных рыбах. Для каждого из трех исследованных круглых червей были получены уникальные и отличительные характеристики паттернов HRM. Профили плавления и пороговые значения циклов (значения Ct), при которых начиналась амплификация, для Anisakis simplex (Rudolphi), Contrcaecum osculatum (Rudolphi) Dujardin, Contrcaecum sp. и Dacnitoides cotylophora (Ward и Magath) были диагностическими для видов. Молекулярный анализ путем секвенирования и сравнения внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) рибосомальной ДНК анализов Dacnitoides, Anisakis и Contrcaecum установил их отчетливую идентичность. Настоящее исследование распространяет молекулярно-филогенетический и морфо-молекулярный анализ для характеристики диагностических компонентов круглых червей cucullanid и anisakid.