Сипхамандла Ламула
Зерновое земледелие в Африке, особенно в странах Африки к югу от Сахары, сталкивается с комбинированным воздействием абиотических (включая засуху и плохую технологию управления урожаем) и биотических (грибковые заболевания и вредители) стрессов. Среди них нематоды-цисты злаков (CCNs) (Heterodera spp.), корневые галловые нематоды (RKN) (Meloidogyne spp.) и нематоды, поражающие корни (RLN) (Pratylenchus spp.), являются основным ограничивающим фактором для производства зерна и считаются экономически важными для пшеницы во всем мире и основными распространителями грибковых инфекций, таких как виды фузариоза. Потери зерновых культур из-за нематод-паразитов растений (PPNs) оцениваются до 6,9–50% (125 млрд долларов США) во всем мире. Ущерб, наносимый этими PPN, их поведение и контроль не получили должного внимания во многих африканских странах, особенно в странах Африки к югу от Сахары, несмотря на указания других стран на то, что урожайность зерновых может быть значительно снижена. Текущее исследование направлено на выявление сообществ нематод, паразитирующих на растениях, в районах производства пшеницы в Южной Африке, с упором на морфологическую и молекулярную идентификацию. Всего было собрано 776 составных образцов ризосферной почвы и корней из 24 местностей за два сезона в провинциях Фри-Стейт (4), Квазулу-Натал (1), Северный Кейп (6) и Западный Кейп (13). Нематоды были извлечены из образцов почвы и корней с использованием адаптированного метода декантации и просеивания, а затем адаптированного метода центрифугирования сахара. Нематоды были извлечены из зерен с использованием замачивания образцов в воде в течение 24 часов и декантации экстракта через сито 20 мкм. Виды нематод были идентифицированы на основе морфометрии и морфологических признаков, в то время как значения известности (PV) были рассчитаны для каждого рода или семейства. Были идентифицированы особи из следующих родов/семейств/отрядов из следующих провинций: Фри-Стейт: Pratylenchus, Rotylenchus, Scutellonema, Helicotylenchus, Criconema и Dolichodorus; Квазулу-Натал: Meloidogyne, Pratylenchus, Criconema, Spiral и Longidorus; Северный Кейп: Pratylenchus, Criconema и Spiral; Западный Кейп: Pratylenchus, Rotylenchus, Scutellonema, Helicotylenchus, Coslenchus, Tylenchus и Xiphinema. Согласно значению PV, преобладающими родами, идентифицированными в местах на сегодняшний день, являются Pratylenchus, Meloidogyne, Spiral, Coslenchus, Tylenchus, Criconema, Longidorus и Xiphinema. В Cedara в Квазулу-Натале было обнаружено большое количество Meloidogyne (420 личинок второй стадии/200 г почвы) по сравнению с другими исследованными местами. Западный Кейп (Малмсбери) показал большое количество Pratylenchus sp. (8750/200 г почвы). В образцах корней PV Meloidogyne в Cedara составил 183, за ним следуют De Vlei (PV=943), Tygerhoek (PV=490), Kopporfontein (PV=134) и Wellington (PV=57) для Pratylenchus sp. В образцах зерен не было обнаружено нематод, паразитирующих на растениях. Однако бактериоядный вид Panagrolaimus был обнаружен в зернах пшеницы из Кларенса в Фри-Стейт,это первый отчет как в Южной Африке, так и во всем мире. D2-D3, 18S рРНК, ITS, ПЦР и SCAR-ПЦР для амплификации обнаруженных родов продолжаются, и на данный момент, среди других экономически важных видов, такие как Pratylenchus thornei, Pratylenchus neglectus и Pratylenchus Bolivian, были амплифицированы, и данные соответствуют данным морфологической и морфометрической идентификации. Из-за их микроскопических размеров вредители-нематоды часто упускаются из виду или неправильно диагностируются.