Журнал интеллектуального анализа данных в геномике и протеомике

Абстрактный

База данных взаимодействий генов и окружающей среды, относящихся к липидным свойствам крови, сердечно-сосудистым заболеваниям и диабету 2 типа

Ю-Чи Ли, Чао-Цян Лай, Хосе М. Ордовас и Лоуренс Д. Парнелл

Важная роль в изменении взаимосвязи между генетическими вариантами и клиническими показателями заболевания, рассмотрение взаимодействий генов и окружающей среды (GxE) является обязательным. Для облегчения включения взаимодействий GxE в исследования ассоциаций отдельных генов и всего генома мы составили из литературы базу данных взаимодействий GxE, имеющих отношение к питанию, липидам крови, сердечно-сосудистым заболеваниям и диабету 2 типа. Более 550 таких взаимодействий были включены в единую базу данных, наряду с более чем 1430 случаями, когда было обнаружено отсутствие статистической значимости. Эта база данных будет служить важным ресурсом для исследователей в области генетики и питания, чтобы получить представление о том, какие точки в геноме человека чувствительны к изменениям в диете, физической активности и употреблении алкоголя, среди других вариантов образа жизни. Кроме того, эта база данных GxE была разработана с учетом будущей интеграции в более крупную базу данных пищевых фенотипов.