Сяохуэй Чен Нильсен, Дерья Каркачи, Римтас Даргис, Лизе Ханнеке, Ульрик Стенц Юстесен, Михаэль Кемп, Йенс Йорген Кристенсен и Монья Хаммер
Виды, которые являются каталазоотрицательными, грамположительными кокками и не относятся к стрептококкам или энтерококкам, становятся все более хорошо охарактеризованными, и число таксономических единиц неуклонно растет на основе молекулярно-таксономических исследований. Это усложняет их идентификацию. Анализ последовательности области межгенного спейсера 16S-23S (ITS) оказался полезным инструментом для идентификации видов родов Streptococcus и Enterococcus. В этом исследовании изучалась возможность использования анализа последовательности ITS в качестве общего инструмента для идентификации видов в пределах родов Aerococcus, Abiotrophia, Alloiococcus, Dolosicoccus, Dolosigranulum, Facklamia, Granulicatella, Gemella, Ignavigranum, Leuconostoc и Vagococcus. Были определены последовательности ITS 29 типовых штаммов и 103 хорошо охарактеризованных клинических штаммов, и был проведен анализ BLAST для идентификации видов. Все клинические штаммы были убедительно идентифицированы до уровня вида. Филогенетический анализ показал отчетливую кластеризацию штаммов с выделенными видами и соответствующими типовыми штаммами. Таким образом, анализ последовательности ITS оказался полезным для идентификации видов бактерий, принадлежащих к родам, которые являются каталазоотрицательными и грамположительными кокками. Потенциально ITS можно рассматривать как инструмент идентификации первой линии для группы каталазоотрицательных, грамположительных кокков, включая негемолитические стрептококки, энтерококки и таксоны, рассмотренные в этом исследовании.